ボートレースは競馬、競輪と同じく公営競技の一つであり、全国24のボートレース場で地方自治体が施行者(主催者)となって開催運営が行われています。
売上はレースを開催する地方自治体の財源や、公益財団法人日本財団を通じて福祉及び公益事業、国際協力事業等に活用されています。

本会は、モーターボート競走法に基づき、国土交通大臣より競走実施機関として指定された唯一の組織です。
主な業務内容は、ボートレースの審判・検査等の競技運営を行うほか、競技のルール改正・選手、 審判員及び検査員の養成・スター選手の育成等を行っています。ボートレースを支える団体として重要な役割を果たしています。

全国に18あった社団法人（都府県）モーターボート競走会および社団法人全国モーターボート競走会連合会を一元化し、財団法人日本モーターボート競走会となり、2012年4月1日、公益法人制度改革に伴い一般財団法人へ移行しました。